update packages file

packages

@@ -586,6 +586,7 @@ R-linprog
 R-lintr
 R-listenv
 R-listviewer
+R-litedown
 R-lle
 R-lme4
 R-lmerTest
@@ -827,7 +828,6 @@ R-reshape
 R-reshape2
 R-reticulate
 R-rex
-R-rgdal
 R-rgenoud
 R-rgeos
 R-rgl
@@ -920,6 +920,7 @@ R-sp
 R-spData
 R-spam
 R-sparkline
+R-sparsevctrs
 R-spatstat
 R-spatstat.core
 R-spatstat.data
@@ -1127,6 +1128,7 @@ appstream-glib
 apr
 apr-util
 arandr
+ardopcf
 argon2
 aria2
 ark
@@ -1212,7 +1214,6 @@ bottom
 bovo
 box2d
 bpftool
-bpftrace
 breeze
 breeze-gtk
 breeze-icons
@@ -1391,6 +1392,7 @@ coreutils
 corosync
 coturn
 cov-core
+cpdb-libs
 cpio
 cppcheck
 cppunit
@@ -1533,6 +1535,7 @@ fakeroot
 falcosecurity-libs
 fann
 farstream
+fast_float
 fastfetch
 faultstat
 fcgi
@@ -1629,6 +1632,7 @@ gi-docgen
 giflib
 gifsicle
 gimp
+gimp-xsanecli
 girara
 git
 git-gui
@@ -2456,6 +2460,7 @@ llvm15
 llvm16
 llvm17
 llvm18
+llvm19
 lm-sensors
 lmdb
 logrotate
@@ -2662,6 +2667,7 @@ numactl
 numatop
 numlockx
 numpy-stl
+nushell
 nut
 nv-codec-headers
 nvme-cli
@@ -2726,6 +2732,7 @@ paho.mqtt.c
 paho.mqtt.cpp
 palapeli
 pam-python
+pam_u2f
 pam_wrapper
 pandas
 pandoc
@@ -3600,7 +3607,6 @@ perl-prefork
 perl-strictures
 pesign
 phonon
-phonon-vlc
 phoronix-test-suite
 php
 php-APCu
@@ -3992,6 +3998,7 @@ pypi-falcon
 pypi-fasteners
 pypi-fastimport
 pypi-fastjsonschema
+pypi-fido2
 pypi-filecache
 pypi-filelock
 pypi-findpython
@@ -4114,8 +4121,8 @@ pypi-iocapture
 pypi-ipaddress
 pypi-ipdb
 pypi-ipykernel
-pypi-ipyparallel
 pypi-ipython
+pypi-ipython-pygments-lexers
 pypi-ipython_genutils
 pypi-ipython_sql
 pypi-ipywidgets
@@ -4458,6 +4465,7 @@ pypi-pyroute2.nftables
 pypi-pyroute2.nslink
 pypi-pyrsistent
 pypi-pysaml2
+pypi-pyscard
 pypi-pyscss
 pypi-pyserial
 pypi-pysnow
@@ -4534,7 +4542,6 @@ pypi-requirements_parser
 pypi-resolvelib
 pypi-responses
 pypi-restructuredtext_lint
-pypi-retrolab
 pypi-retry
 pypi-retry_decorator
 pypi-retryz
@@ -4545,6 +4552,7 @@ pypi-rfc3987
 pypi-rich
 pypi-rjsmin
 pypi-rlpycairo
+pypi-roman_numerals_py
 pypi-rope
 pypi-routes
 pypi-rpds_py
@@ -4719,6 +4727,7 @@ pypi-typogrify
 pypi-tzdata
 pypi-tzlocal
 pypi-ua_parser
+pypi-ua_parser_builtins
 pypi-uc_micro_py
 pypi-ufolib2
 pypi-uharfbuzz
@@ -4739,6 +4748,7 @@ pypi-uvloop
 pypi-venusian
 pypi-verboselogs
 pypi-versioneer
+pypi-versioningit
 pypi-vine
 pypi-virtualenv
 pypi-volatile
@@ -4770,7 +4780,6 @@ pypi-wsproto
 pypi-wurlitzer
 pypi-wxPython
 pypi-xcffib
-pypi-xgboost
 pypi-xmldiff
 pypi-xmljson
 pypi-xmlschema
@@ -4798,6 +4807,7 @@ pypi-yarg
 pypi-yarl
 pypi-yattag
 pypi-ypy_websocket
+pypi-yubikey_manager
 pypi-zabbix_api
 pypi-zc.lockfile
 pypi-zeroconf
@@ -4956,6 +4966,7 @@ recode
 redis2-nginx-module
 redland
 redsocks
+redumper
 requests-ntlm
 rest
 restic
@@ -5176,6 +5187,7 @@ umockdev
 unbundle
 unibilium
 unifdef
+unified-memory-framework
 unison
 unit
 unixODBC
@@ -5213,7 +5225,6 @@ virglrenderer
 virt-manager
 virt-viewer
 vkd3d
-vlc
 volk
 volume_key
 vpnc
@@ -5332,6 +5343,7 @@ xrandr
 xrdb
 xrdp
 xrestop
+xsane
 xscorch
 xscreensaver
 xsel
@@ -5359,6 +5371,7 @@ yelp-tools
 yelp-xsl
 yq
 ytnef
+yyjson
 zabbix
 zathura
 zathura-pdf-poppler